Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smndc1Q8BGT7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms