Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms