Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Atg4bQ8BGE6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg4bQ8BGE6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg4bQ8BGE6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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