Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU0

Rspo2, R-spondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo2Q8BFU0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo2Q8BFU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms