Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms