Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ubp1Q811S7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ubp1Q811S7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ubp1Q811S7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ubp1Q811S7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubp1Q811S7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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