Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms