Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms