Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim19Q80ZU4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms