Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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