Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms