Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5bQ80Y84 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms