Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms