Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnupnQ80W37 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnupnQ80W37 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnupnQ80W37 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms