Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms