Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo2Q7TSY8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms