Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms