Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NexnQ7TPW1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NexnQ7TPW1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NexnQ7TPW1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NexnQ7TPW1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NexnQ7TPW1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms