Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms