Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Mycbp2Q7TPH6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms