Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snd1Q78PY7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms