Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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