Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme8Q715T0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms