Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms