Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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