Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Topbp1Q6ZQF0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms