Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf653Q6YND2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf653Q6YND2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf653Q6YND2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf653Q6YND2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf653Q6YND2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf653Q6YND2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms