Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms