Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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