Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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