Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms