Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms