Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms