Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms