Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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