Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms