Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms