Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgb4Q6P8W9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgb4Q6P8W9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms