Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms