Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms