Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrimpolQ6P1E7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrimpolQ6P1E7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms