Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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