Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms