Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms