Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt40Q6IFX3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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