Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms