Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edrf1Q6GQV7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms