Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms