Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms