Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pram1Q6BCL1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pram1Q6BCL1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms